Από κλιματική άποψη, η Μπίτολα παρουσιάζει αρκετά χαρακτηριστικά που αξίζει να επισημανθούν.
Στη Μπίτολα, ο κύριος μετεωρολογικός σταθμός άρχισε να λειτουργεί επίσημα στις 16 Μαρτίου 1945, αν και για ορισμένα μετεωρολογικά στοιχεία υπάρχουν συστηματικά δεδομένα ήδη από το 1926/27. Ο σταθμός βρίσκεται σε υψόμετρο 586 μέτρων.
Σύμφωνα με τα μετεωρολογικά δεδομένα, η πόλη έχει μέση ετήσια θερμοκρασία αέρα 11,1°C, με σημαντικές αποκλίσεις σε ορισμένα έτη — από 10,1°C (1975) έως 13,1°C (1952).
Ο ψυχρότερος μήνας είναι ο Ιανουάριος, με μέση θερμοκρασία 0,6°C και απόλυτο ελάχιστο -30,4°C. Ο θερμότερος μήνας είναι ο Ιούλιος, με μέση θερμοκρασία 22,2°C και απόλυτο μέγιστο 41,2°C. Το ετήσιο θερμοκρασιακό εύρος φτάνει τους 71,6°C, χαρακτηριστικό περιοχών με ηπειρωτικό κλίμα.
Η άνοιξη και το φθινόπωρο έχουν συνήθως ήπιες θερμοκρασίες, αλλά ενδέχεται να παρουσιάσουν χαρακτηριστικά παρατεταμένου χειμώνα ή καλοκαιριού. Γενικά, το κλίμα της Μπίτολα είναι εύκρατο ηπειρωτικό με έντονη ηπειρωτική επίδραση, με δυναμικό και σχετικά ασταθές χαρακτήρα: ξηρά και πολύ ζεστά καλοκαίρια και χειμώνες που χωρίζονται σε μια σύντομη, ξηρή και ψυχρή περίοδο. Η θερμοκρασία παρουσιάζει ηπειρωτικά χαρακτηριστικά, ενώ οι βροχοπτώσεις θυμίζουν ξηρό, τροποποιημένο μεσογειακό ή και ημι-στεπικό κλίμα, με περιστασιακές εισβολές θερμών αερίων μαζών από τη Σαχάρα.
Η μέση ετήσια βροχόπτωση ανέρχεται σε 601 mm, με διακυμάνσεις από 338 mm έως 879 mm, διαφορά που προσεγγίζει τον μέσο όρο.
Τέλος, η Μπίτολα αποτελεί ένα από τα σημεία όπου έχει καταγραφεί το φαινόμενο του πολικού σέλαος. Η ισοχασμική γραμμή 0,1 (που συνδέει περιοχές με ίδιο αριθμό ημερών εμφάνισης του φαινομένου) διέρχεται από την πόλη, πράγμα που σημαίνει ότι το φαινόμενο εμφανίζεται κατά μέσο όρο μία φορά κάθε 10 χρόνια.
