Οι σχετικά ευνοϊκές φυσικές συνθήκες επέτρεψαν στην περιοχή της Μπίτολα, αλλά και ευρύτερα, να διαθέτει στο παρελθόν μεγάλο πλούτο δασικών πόρων. Τα μεγαλύτερα και ποιοτικότερα δασικά συμπλέγματα στον Δήμο Μπίτολα εκτείνονται στην περιοχή της κορυφής Καϊμακτσαλάν στο όρος Νίτζε, στην κορυφή Pelister με την οροσειρά της Μπάμπα, καθώς και σε τμήματα του όρους Μπίγκλα.
Τα πιο συνηθισμένα είδη δέντρων είναι: λευκή πεύκη, μαύρη πεύκη, σκλήθρο, οξιά, δρυς, έλατο και λεύκη. Η περιοχή του Καϊμακτσαλάν καλύπτει έκταση 14.800 εκταρίων με αποθέματα ποιοτικών δασών (μαύρη πεύκη, πεύκη, έλατο, οξιά κ.ά.).
Η περιοχή της Μπάμπα Πλάνινα με την κορυφή Πέλιστερ, εξαιρουμένου του Pelister National Park (το πρώτο εθνικό πάρκο στη Μακεδονία, που ανακηρύχθηκε το 1948), καλύπτει έκταση 10.400 εκταρίων. Από αυτά, η πεύκη «μολίκα» (Pinus peuce), ένα αυτόχθονο ενδημικό είδος πεντάβελο πεύκου που ανακαλύφθηκε από τον August Grisebach το 1839, καταλαμβάνει μια αυστηρά προστατευόμενη ζώνη 1.600 εκταρίων.
Στις ανατολικές πλαγιές της Μπάμπα Πλάνινα απαντώνται χαμηλόκορμα δάση: δρυς σε 8.180 εκτάρια, οξιά σε 2.067 εκτάρια και άλλα δασικά είδη σε 840 εκτάρια, συνολικά 11.087 εκτάρια. Η βλάστηση του Πέλιστερ έχει ιδιαίτερη βοτανική σημασία, καθώς εδώ αναπτύσσονται 88 είδη ξυλωδών φυτών, που ανήκουν σε 23 οικογένειες.
Η ορεινή βλάστηση του Πέλιστερ διακρίνεται σε 19 φυτοκοινωνίες, 11 ενώσεις και 7 τάξεις. Η άγρια πανίδα της περιοχής περιλαμβάνει 62 είδη ζώων, μεταξύ των οποίων ξεχωρίζουν το ελάφι, το ζαρκάδι, το αγριόγιδο, ο αγριόχοιρος, η αρκούδα, ο λύγκας, ο λαγός, ο λύκος, η πέρδικα και η πετροχελίδονα.
Από τα είδη ψαριών, ιδιαίτερη σημασία έχουν η πέστροφα Salmo trutta peristericus και η πελαγονική καφέ πέστροφα Salmo trutta pelagonicus.
